José Miguel Moreno nace en Madrid y comienza su andadura musical, de la mano de su padre, a muy temprana edad.  Durante su período de formación gana, entre otros, el primer premio en el Incontri Chitarristici di Gargnano (Italia 1977).  Se ha especializado en la interpretación histórica, siendo su repertorio muy amplio (desde el siglo XVI a principios del XX) y lo interpreta con instrumentos de época: vihuela, guitarra renacentista y barroca, laúd renacentista y barroco, tiorba y guitarra clásico-romántica; todos ellos originales o copias fidedignas. En este campo, José Miguel Moreno es unánimemente reconocido como uno de los mayores especialistas de la actualidad.

Ha actuado en los festivales y centros musicales más importantes de Europa, Australia, Asia y América:  Wiener Musikverein, Festivales de Granada, Flandes, Théatre des Champs Elysées de París, Teatro Real y Auditorio de Madrid, Brisbane Biennial, Wigmore Hall de Londres, Sala Pushkin de Moscú, la Sala Glazunov de San Petersburgo, el  Metropolitan Museum de Nueva York, Konzerthaus de Viena , los Festivales de Música Antigua de Brujas, Barcelona, Utrecht, Stuttgart, Innsbruck, Escorial, Nantes, Saintes, Ribeauvillé, París, Hokutopia de Tokio,  Festival de Música Antigua de San Petersburgo, Praga, Riga, Tallin, etc.  En casi todos los países visitados, ha grabado para la radio y la televisión.

Durante mucho tiempo, colaboró regularmente con Teresa Berganza. También realizó numerosas giras y grabaciones con Hespèrion XX (entre ellas, las Lachrimae de John Dowland, para laúd y conjunto de violas).  En 1990 fundó el Ensemble La Romanesca, y en 1999 el conjunto Orphénica Lyra, dedicados ambos a la interpretación de la música renacentista y barroca española y europea.  Su labor pedagógica la ha desarrollado desde 1980, siendo profesor invitado de universidades, conservatorios y cursos en Europa, América y Asia.  Junto a la Luthier, Lourdes Uncilla, investigó, durante años, sobre la construcción histórica de los instrumentos de la familia del laúd y la guitarra. 

José Miguel Moreno ha grabado para Philipps, EMI, Glossa, Deutsche Harmonia Mundi y Astrée.  Desde 1992 graba en exclusiva para Glossa, sello del que es cofundador.

Prácticamente la totalidad de su discografía ha sido distinguida con los galardones que otorga la prensa especializada (Choc de Le Monde de la Musique, Diapason d’Or, 10 de Répertoire, Editor’s Choice de Gramophone, Want List de Fanfare, Premios CD Compact, Premios Ritmo, 5 estrellas de Goldberg, Premio Internacional de la Fondazione Giorgio Cini de Venecia, etc).

Como distinciones ha ganado el Premio Trujamán de La Guitarra en 2003, el Premio de Socio de honor de Amigos de La Guitarra de Valencia en 2016, El Premio de Socio de honor de La Sociedad de La Vihuela en 2017, el Premio de Honor de GEMA en 2020 , el Premio de Honor de European Guitar Foundation en 2021 y el Premio Honorífico 2025 del Certamen Llobet,  entre otros.